Setiap pagi sebelum memulai pembelajaran, para murid bersama dewan guru melaksanakan salat Duha secara berjamaah. Kegiatan ini menjadi salah satu upaya madrasah untuk menanamkan nilai-nilai keagamaan sekaligus membangun kedisiplinan dan keteladanan dalam kehidupan sehari-hari.

Usai melaksanakan salat Duha berjamaah, kegiatan dilanjutkan dengan tadarus Al-Qur'an. Para murid bersama guru membaca ayat-ayat suci Al-Qur'an dengan tertib dan khusyuk. Selain itu, guru membimbing murid yang masih membaca Iqra’.  Melalui kegiatan tadarus ini, diharapkan peserta didik semakin dekat dengan Al-Qur'an serta terbiasa mengawali aktivitas belajar dengan suasana yang religius dan penuh keberkahan.

Tidak hanya pada pagi hari, pembiasaan beribadah juga dilanjutkan pada siang hari melalui pelaksanaan salat Zuhur secara berjamaah. Seluruh peserta didik dan guru bersama-sama melaksanakan ibadah tersebut dengan tertib di lingkungan madrasah.

Penerapan kebiasaan beribadah ini merupakan bagian dari komitmen MTsN Tojo Una-Una dalam mendukung pembentukan karakter peserta didik yang tidak hanya unggul dalam bidang akademik, tetapi juga memiliki keimanan, ketakwaan, kedisiplinan, dan akhlak yang baik.

Melalui pembiasaan yang dilakukan secara rutin dan konsisten, madrasah berharap nilai-nilai positif tersebut dapat tertanam dalam diri para murid dan menjadi kebiasaan yang mereka terapkan, baik di lingkungan madrasah, keluarga, maupun masyarakat.

Kegiatan salat Duha berjamaah, tadarus Al-Qur'an, dan salat Zuhur berjamaah menjadi bukti nyata bahwa MTsN Tojo Una-Una terus berupaya menciptakan lingkungan pendidikan yang religius sekaligus mendukung terwujudnya generasi Anak Indonesia Hebat yang berkarakter, berakhlak mulia, dan memiliki semangat untuk meraih masa depan yang gemilang.